经教育部评估，2016年我市共24所学校被认定为国家级校园足球特色学校。加上2015年评选的19所学校，我市共有43所国家级校园足球特色学校。现将2016年评选的国家级足球特色学校名单公布如下。
济宁学院附属中学
济宁市霍家街小学
山东省济宁市东门大街小学
任城区喻屯第二中学
山东省济宁市第二中学
济宁市任城区长沟中心小学
济宁市第十三中学
任城区长沟中学
山东省微山县夏镇街道第一中学
金乡县第一中学
嘉祥县实验小学
汶上县郭楼镇中心小学
汶上县开发区小学
山东省泗水县龙城初级中学
泗水县实验小学
山东省梁山县第一实验小学南校区
曲阜市石门山镇中学
曲阜市时庄街道大庙小学
曲阜鲁城街道书院街小学
曲阜市舞雩坛小学
邹城市凫山小学
邹城市匡衡路小学教育集团
邹城市第一中学
济宁市北湖小学